Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms