Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIPC3Q8TF64 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIPC3Q8TF64 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms