Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRSK1Q8TDC3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms