Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ZNF439Q8NDP4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ZNF439Q8NDP4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ZNF439Q8NDP4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ZNF439Q8NDP4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ZNF439Q8NDP4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ZNF439Q8NDP4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ZNF439Q8NDP4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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