Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KBTBD3Q8NAB2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms