Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms