Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL6Q8N841 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL6Q8N841 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL6Q8N841 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms