Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMTC2Q8N394 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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