Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms