Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms