Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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UBE2Q1Q7Z7E8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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UBE2Q1Q7Z7E8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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UBE2Q1Q7Z7E8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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UBE2Q1Q7Z7E8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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UBE2Q1Q7Z7E8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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UBE2Q1Q7Z7E8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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UBE2Q1Q7Z7E8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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UBE2Q1Q7Z7E8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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UBE2Q1Q7Z7E8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2Q1Q7Z7E8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms