Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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