Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms