Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms