Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms