Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms