Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms