Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO2Q5TF58 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO2Q5TF58 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms