Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TCTE1Q5JU00 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms