Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms