Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms