Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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