Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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