Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEACAM16Q2WEN9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEACAM16Q2WEN9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms