Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms