Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms