Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms