Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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GABRA6Q16445 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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GABRA6Q16445 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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