Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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