Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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