Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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