Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms