Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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