Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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