Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms