Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms