Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK13Q14004 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK13Q14004 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
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