Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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