Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ATRQ13535 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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ATRQ13535 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ATRQ13535 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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ATRQ13535 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ATRQ13535 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ATRQ13535 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ATRQ13535 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ATRQ13535 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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