Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms