Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RPA4Q13156 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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