Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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