Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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