Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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BNIP1Q12981 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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