Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FOXC1Q12948 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FOXC1Q12948 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FOXC1Q12948 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FOXC1Q12948 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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FOXC1Q12948 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FOXC1Q12948 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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FOXC1Q12948 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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FOXC1Q12948 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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