Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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