Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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