Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms