Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms