Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms